Ce cours sur l'introduction à la dynamique moléculaire a pour objet de présenter la méthodologie pour effectuer une simulation de dynamique moléculaire sur des systèmes variés dans des conditions thermodynamiques variées.
Ce cours présentera:
- les principes de la dynamique moléculaire
- la notion de champs de force
- comment représenter les interactions intra-moléculaires et inter-moléculaires
- comment faire d'un système microscopique un échantillon macroscopique, quels sont les problèmes sous-jacents et comment les résoudre
- les principaux algorithmes d'intégration
- la notion de pas d'intégration
- comment prendre en compte la température et la pression
- le cas particulier des interactions électrostatiques
- le régime transitoire et le régime d'équilibre
- comment extraire des informations pertinentes
- quelques exemples caractéristiques
- Profesor: Patrice Bordat